具体的にどう、というのはかなり曖昧で謎なのですが・・ソースからメークするときに使う「make」コマンドにバグがあります。（リリース4.9で確認）たとえば、proftpdのmakeをシェルスクリプトに書いて実行するとなぜか、エラーになったりならなかったりします。

原因も解決策はよくわからないので、とりあえず、GNU makeをインストールして使いましょう。